琼中县人民检察院于1956年4月10日在乘坡建院， 1967年3月，实行军事管制，“公、检、法”并为一体，检察院无法正常履行法律监督职能。翌年，县革委会保卫组取代“公、检、法”。

1978年11月，琼中县人民检察院恢复重建。1986年10月，升格为副处级单位，1987年12月28日，改称琼中黎族苗族自治县人民检察院。

2017年，根据国家监察体制改革工作部署要求，积极配合改革试点工作，11月，琼中黎族苗族自治县人民检察院正式将反贪污贿赂局、反渎职侵权局的8名检察干警转隶到县监察委。2019年，根据检察机关内设机构改革要求，5月，内设机构调整为五部两室，分别是：综合管理部、第一检察部（未成年人检察部与第一检察部合署办公）、第二检察部（驻县看守所检察室）、第三检察部、第四检察部（司法警察大队与第四检察部合署办公），派驻长征检察室、派驻湾岭检察室。

现有政法专项编制39名，实有政法专项编制检察干警36人，平均年龄38.8岁。其中，检察官14人，检察官助理12人、司法警察2人、综合行政人员6人；党员20人，占55.56 %；硕士研究生学历3人、本科学历33人，本科及以上学历占比100%；法学专业或非法学专业通过司法考试28人，占比80.00%。另有机关工勤1人，退休返聘人员1人，聘用制书记员15人，司法雇员7人。

本届党组现有3名成员，分别是：党组书记庄二华同志，党组成员、副检察长吴春宏同志，党组成员、副检察长陈应雄同志。