琼海市人民检察院成立于1955年7月，前身为广东省琼海县人民检察院。1988年海南建省时，更名为海南省琼海县人民检察院。1992年11月琼海撤县设市后，更名为琼海市人民检察院，系县级检察机关。办公地址位于琼海市银海路。

现有政法编制57名。设有办公室、政治部、第一检察部（未成年人检察部与第一检察部合署办公）、第二检察部、第三检察部、第四检察部、第五检察部、第六检察部（司法警察大队与第六检察部合署办公）8个内设机构和长坡检察室、潭门海洋检察室、中原检察室3个派驻乡镇检察室。

建院以来，先后获得多项国家级和省、市级荣誉。曾荣获“全国十佳基层检察院提名奖”“全国先进基层检察院”、“全国检察机关第七次‘双先’模范检察院”“全国文明单位”“全国普法工作先进单位”“全国维护妇女儿童权益先进集体”等荣誉。