2012年7月24日，三沙市人民检察院与三沙市人民政府同日挂牌成立，经报最高人民检察院批复，2014年1月27日增设县一级三沙群岛人民检察院。

　　三沙市两级检察院地处祖国最南端，自建院以来，始终坚持党中央设立三沙市确定的南海“维权、维稳、保护、开发”的海洋强国战略，在省检察院和市委的领导下，紧紧围绕中国特色海南自由贸易港建设和美好新三沙建设中心工作，聚焦法律监督主责主业，重点开展了南海维权维稳、打击破坏海洋生态犯罪、公益诉讼和涉海涉外检察工作调研等工作，为三沙建设发展提供了坚实的司法保障。